Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms