Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cttnbp2B9EJA2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.64
Cttnbp2B9EJA2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cttnbp2B9EJA2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms