Protein–RNA interactions for Protein: B9EHI3

1700006A11Rik, 1700006A11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700006A11RikB9EHI3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
1700006A11RikB9EHI3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms