Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnldc1B2RXZ1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms