Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cspp1B2RX88 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms