Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apba1B2RUJ5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms