Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PtprbB2RU80 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PtprbB2RU80 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PtprbB2RU80 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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PtprbB2RU80 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PtprbB2RU80 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PtprbB2RU80 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PtprbB2RU80 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PtprbB2RU80 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PtprbB2RU80 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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