Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zscan5bB2RTN3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms