Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrn3B2RS91 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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