Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brpf1B2RRD7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms