Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms