Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem238A9JSM3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem238A9JSM3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms