Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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