Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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