Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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