Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CtcflA2APF3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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