Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frmpd1A2AKB4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd1A2AKB4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms