Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pramel3A2AHA7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms