Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc163A2AGD7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms