Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms