Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb4A2A863 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb4A2A863 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb4A2A863 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb4A2A863 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb4A2A863 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb4A2A863 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb4A2A863 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb4A2A863 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb4A2A863 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms