Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms