Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trav12-2A0N8N6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms