Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms