Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Top3bQ9Z321 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Top3bQ9Z321 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Top3bQ9Z321 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Top3bQ9Z321 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Top3bQ9Z321 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Top3bQ9Z321 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Top3bQ9Z321 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Top3bQ9Z321 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Top3bQ9Z321 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3bQ9Z321 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms