Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubl3Q9Z2M6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubl3Q9Z2M6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms