Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J0

Slc23a1, Solute carrier family 23 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc23a1Q9Z2J0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc23a1Q9Z2J0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc23a1Q9Z2J0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms