Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mbd3Q9Z2D8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms