Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccne2Q9Z238 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms