Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lgr5Q9Z1P4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms