Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx39bQ9Z1N5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms