Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1Q9Z179 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms