Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup160Q9Z0W3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup160Q9Z0W3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms