Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slfn1Q9Z0I7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slfn1Q9Z0I7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slfn1Q9Z0I7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slfn1Q9Z0I7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slfn1Q9Z0I7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slfn1Q9Z0I7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slfn1Q9Z0I7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slfn1Q9Z0I7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slfn1Q9Z0I7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slfn1Q9Z0I7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slfn1Q9Z0I7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slfn1Q9Z0I7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slfn1Q9Z0I7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slfn1Q9Z0I7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slfn1Q9Z0I7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn1Q9Z0I7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms