Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacsin2Q9WVE8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms