Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Stxbp4Q9WV89 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms