Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms