Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13bQ9WU72 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms