Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdh13Q9WTR5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdh13Q9WTR5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdh13Q9WTR5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdh13Q9WTR5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms