Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TapbpQ9R233 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TapbpQ9R233 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms