Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trex2Q9R1A9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms