Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamc3Q9R0B6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms