Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms