Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms