Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms