Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tomm40Q9QYA2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tomm40Q9QYA2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Tomm40Q9QYA2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tomm40Q9QYA2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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