Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkp3Q9QY23 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms