Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms