Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Trpc5Q9QX29 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Trpc5Q9QX29 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Trpc5Q9QX29 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Trpc5Q9QX29 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Trpc5Q9QX29 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Trpc5Q9QX29 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc5Q9QX29 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc5Q9QX29 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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