Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms